Почти полсотни неизвестных вирусов найдены в планктоне на Байкале

Новосибирск. 27 января. ИНТЕРФАКС - Ученые обнаружили в планктоне озера Байкал 47 CRESS-подобных (Circular Rep-encoding single-stranded) ДНК-вирусов, сообщает издание СО РАН "Наука в Сибири".

"Особенность CRESS-вирусов отражена в их названии - Circular Rep-encoding single-stranded (CRESS) DNA viruses, все они реплицируются по принципу катящегося кольца. Их геном - это маленькая кольцевая одноцепочечная ДНК (оцДНК), у многих представителей ее длина составляет менее десяти тысяч нуклеотидов", - приводятся в сообщении слова соавтора исследования, научного сотрудника Лимнологического института СО РАН (ЛИН СО РАН, Иркутск) Сергея Потапова.

Эта ДНК кодирует капсидный белок и характерный белок Rep (Replication initiator protein), который необходим для репликации вируса.

CRESS-вирусы включает 24 семейства, они имеют широкий круг хозяев: от архей (по некоторым данным) до животных.

Соавторы работы - группа ученых из ЛИН СО РАН и НИИ эпидемиологии и микробиологии имени Пастера, Санкт-Петербург ранее встречали генетические последовательности этих вирусов в метагеномных данных из воды озера Байкал, но до этого исследования детально не изучали.

Ученые пришли к выводу, что байкальские CRESS-вирусы являются новыми, не имеющими 100% сходства с известными в базах данных, при этом они обладают довольно высокой скоростью мутации.

Кроме того, CRESS-ДНК-вирусы представляют собой динамичную популяцию, в которой обмен фрагментами генов чрезвычайно распространен.

Некоторые байкальские CRESS-вирусы имеют сходство с аналогичными вирусами из США, Новой Зеландии, Швеции, но у большинства последовательностей сходство с другими вирусами было невысоким.

Предполагается, что хозяевами CRESS-вирусов Байкала могут быть членистоногие, моллюски, рыбы, ученые не выявили никаких признаков опасности обнаруженных байкальских CRESS-вирусов для человека.

Самое важное и интересное — "Интерфакс-Россия" в МАХ