Ученые СПбГУ разработали интернет-браузер для проведения геномных исследований

Санкт-Петербург. 5 ноября. ИНТЕРФАКС СЕВЕРО-ЗАПАД - Ученые Центра геномной биоинформатики им.Добржанского Санкт-Петербургского государственного университета разработали и запустили интернет-платформу GWATCH, которая призвана повысить эффективность геномных исследований.

Как сообщила пресс-служба СПбГУ в среду, интернет-платформа создана для автоматического анализа данных с целью обнаружения генов, отвечающих за хронические заболевания человека.

В пресс-службе отмечают, что за последнее десятилетие лишь некоторые исследования по поиску генов, "отвечающих" за опасные заболевания, смогли выявить основные генетические детерминанты, которые удалось применить на практике. Процесс поиска таких "генных зависимостей" осложняется большим количеством имеющихся данных. Для более удобного поиска геномных данных и был создан браузер GWATCH.

Геномный браузер GWATCH позволит исследователям просматривать данные геномных ассоциаций, подтверждать новые ассоциации и обнаруживать важные аспекты генетического воздействия, отмечается в релизе.

"Аббревиатура GWATCH расшифровывается как Genome-Wide Association Tracks Chromosome Highway, что означает "хромосомная магистраль для полногеномного поиска ассоциаций". В основе геномного браузера лежит динамический принцип работы, позволяющий непосредственным образом обнаруживать, просматривать и оценивать картину (паттерн) геномных ассоциаций на основе обширных массивов данных", - говорится в сообщении.

В браузере можно увидеть любую хромосому "с высоты птичьего полета", в трехмерном изображении. Это позволит выявить участки генома, значимые с точки зрения ассоциации с конкретными заболеваниями.

Браузер GWATCH учитывает и требования конфиденциальности личной информации. Данные здесь хранятся в открытом доступе, однако персональные сведения больных не раскрываются.

Геномный браузер GWATCH был разработан учеными из Центра геномной биоинформатики им.Добржанского СПбГУ. Создание браузера частично финансировалось из средств программы мегагрантов министерства образования и науки РФ.