Новосибирск. 19 декабря. ИНТЕРФАКС - Специалисты лаборатории структурной биологии Института химической биологии и фундаментальной медицины СО РАН (ИХБФМ) во взаимодействии с коллегами из Института биоорганической химии РАН (Москва) и Шведского университета сельскохозяйственных наук подобрали соединение, которое, возможно, сможет блокировать вирус лихорадки денге, сообщает издание СО РАН "Наука в Сибири".
Результаты опубликованы в журнале Nature Communications Biology.
"Сейчас у нас уже есть модельное соединение, которое предположительно может сработать. Мы исследуем, как оно взаимодействует с белком (вируса денге - ИФ), где находится, какая структура у этого комплекса. Знания о структуре необходимы, чтобы понять в деталях, как функционирует белок. Дальше их можно использовать для создания и улучшения ингибитора", - приводятся в сообщении слова замдиректора ИХБФМ, завлабораторией структурной биологии ИХБФМ Александра Ломзова.
Ученые установили, что целевой белок, сериновая протеаза, который помогает вирусу проникнуть в клетку и при этом сам себя расщепляет, является динамичным и набор его конформаций (структурных форм) может быть разным.
"Это важно учитывать при поиске терапевтических соединений. Сейчас у нас уже есть модельное соединение, которое предположительно может сработать", - сказал Ломзов.
По его словам, провести такое обширное исследование удалось благодаря работе молодежной лаборатории. "Для нашей молодежной лаборатории мы построили вычислительный комплекс. Если бы его не было, мы бы существенно медленнее двигались к получению результатов", - заметил ученый.
Ранее Ломзов сообщал, что до этих исследований структура сериновой протеазы вируса денге была определена неправильно. Ингибитор может быть создан на основе пептидных молекул, небольших фрагментов белка, отмечал он.
